يعود تاريخ النزاعات الحدودية بين البلدين إلى فترة استقلالهما بعد انهيار الاتحاد السوفييتي بداية تسعينات القرن الماضي.

وفي الوقت الذي تنتظر فيه تلك المشاكل حلا بين دول آسيا الوسطى التي نالت استقلالها عام 1991، تشهد دول المنطقة من وقت لآخر توترات ومناوشات.

على خلفية النزاع الاخير، قالت الهيئة الإقليمية لمكافحة الإرهاب التابعة لمنظمة شنغهاي للتعاون، إنه لا يجوز بتاتا استخدام السلاح على الحدود بين قرغيزستان وطاجيكستان، ودعت الجانبين إلى التوافق والحلول الوسط.

وأضافت الهيئة، في بيان نشرته على موقعها: "تعرب اللجنة التنفيذية للهيئة، عن قلقها من التصعيد الجديد للتوتر على الحدود القرغيزية - الطاجيكية، وتعتبر استخدام السلاح غير مقبول، لأنه يشكل الخطر على حياة وصحة المواطنين في المنطقة".

ودعت الهيئة، الجانبين إلى "تعاون ثنائي مسؤول للتوصل إلى حل وسط لإجمالي مشاكل الحدود ومن خلال الوسائل الدبلوماسية حصرا".

منظمة شنغهاي للتعاون، هي منظمة دولية تأسست عام 2001. وتضم، الهند وكازاخستان والصين وقرغيزستان وروسيا وطاجيكستان وباكستان وأوزبكستان.

 والدول المراقبة في هذه المنظمة، أفغانستان وبيلاروس وإيران ومنغوليا، والدول الشريكة هي أذربيجان وأرمينيا وكمبوديا ونيبال وتركيا وسريلانكا.